基础部始建于1980年，现设有2个专业：信息管理与信息系统专业、环境科学专业；7个教研室：数学教研室、物理教研室、信息管理科学教研室、分析化学教研室、无机化学教研室、有机化学教研室、物理化学教研室和1个基础化学实验中心。

信息管理与信息系统专业拥有硕士、博士学位授予点，分析化学学科拥有硕士学位授予点。另拥有药物化学和药物分析专业硕士、博士学位授予点。基础部现有教职工180人，其中教授9人，副教授49人。近年来，基础部完成或承担国家和企业的科研项目近百项，国家级、省部级、校级教改课题数十项，主编“十五”、“十一五”国家规划教材数十部，省级精品课程3门，获国家级教学成果一等奖1项、二等奖1项，省级特等奖1项、二等奖2项，省级精品教材奖2项。

基础部以培养高素质创新型药学人才为目标，着力推进大学生素质教育，组织开展了一系列高层次、高品位的校园科技文化活动，努力创造更好的育人环境，促进了校园精神文明建设。神州嘉年华、校园集体舞大赛、寝室文化节、三人创意演讲比赛充分展示了当代学子的风采；8个校外爱国主义教育实践基地的主题活动立意深刻、形式新颖；暑期社会实践活动多次获得省级荣誉，全国大学生数学建模比赛和“挑战杯”各类赛事成绩喜人。面对新的机遇和挑战，基础部将竭诚与社会各界携起手来，全部上下共谋发展，以学科建设为主线，坚持育人为本，“学、研、产”相结合的办学思路，发扬“精业济群”的优良校风。